systems biology पेपर

Cure-screening predicts mechanism of post-antibiotic relapse in Tuberculosis

एक कम्प्यूटेशनल मॉडल का उपयोग करते हुए, यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि क्या तपेदिक (टीबी) का पुनरावृत्ति (रिलैप्स) अवशिष्ट प्रतिकृति बनाने वाले बैक्टीरिया द्वारा संचालित होता है या केसियम (caseum) में फंसे गैर-प्रतिकृति बनाने वाले बैक्टीरिया के पुनर्सक्रियन द्वारा, यह इस बात पर बहुत अधिक निर्भर करता है कि उपचार पूरा होने पर रोगियों की उपचार मुक्ति (क्यूर) के लिए जांच की जाती है या नहीं, जो यह सुझाव देता है कि उपचार के बाद की पुनरावृत्ति के लिए बेहतर केसियम प्रवेश क्षमता वाले एंटीबायोटिक्स की आवश्यकता हो सकती है।

Michael, C. T., Budak, M., Lin, P. L., Kirschner, D. E.2026-04-27

📄 systems biology

A landscape description of the dynamics of Turing patterns

यह शोध पत्र विभिन्न नेटवर्क आकारों और बाहरी मॉर्फोजेन कपलिंग्स के माध्यम से ट्यूरिंग पैटर्न की गतिशीलता का वर्णन करने के लिए पोटेंशियल फ्लो पर आधारित एक सार्वभौमिक लैंडस्केप फ्रेमवर्क प्रस्तावित करता है, जो डिजिट पैटर्निंग के दौरान SOX9 अभिव्यक्ति को समझाने के लिए इस मात्रात्मक मॉडल को सफलतापूर्वक लागू करता है।

Shinde, S., Raju, A.2026-04-17

📄 systems biology

Orchard management alters citrus root and rhizosphere microbiomes with functional consequences for plant performance

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि बाग प्रबंधन पद्धतियां, विशेष रूप से लकड़ी का मल्च (wood mulch) अनुप्रयोग, साइट्रस राइजोस्फीयर माइक्रोबायोम को उन तरीकों से महत्वपूर्ण रूप से पुनर्गठित करती हैं जो कारणवश पौधों के प्रदर्शन को कम करते हैं, जबकि ह्यूमिक एसिड मुख्य रूप से प्रत्यक्ष अजैविक तंत्रों के माध्यम से विकास को प्रभावित करता है।

Ginnan, N., Jones, R., Wu-Woods, J., Pervaiz, T., El-kereamy, A., Ashworth, V. E., Hamid, M. I., Dawson, E. K., Strauss (…)2026-04-17

📄 systems biology

Mapping kidney trait heritability to individual cells reals disease-specific remodeling of genetic risk architecture

यह अध्ययन सिंगल-सेल और स्पेशियल ट्रांसक्रिप्टोमिक्स को GWAS डेटा के साथ एकीकृत करके किडनी जेनेटिक डिजीज सेल एटलस का निर्माण करता है ताकि यह प्रकट किया जा सके कि किडनी के लक्षणों के लिए आनुवंशिक जोखिम संरचनाएं विशिष्ट कोशिका प्रकारों और रोग स्थितियों में गतिशील रूप से कैसे पुनर्गठित होती हैं, और अंततः स्थिति-विशिष्ट चिकित्सीय लक्ष्यों की पहचान की जा सके।

Hu, H.2026-04-16

📄 systems biology

NovoGlyco: mapping protein glycosylation in prokaryotes

नवोग्लाइको (NovoGlyco) एक मॉड्यूलर, अनटारगेटेड ग्लाइकोप्रोटीओमिक्‍स प्लेटफॉर्म है जो प्रोकैरियोट्स में विविध प्रोटीन ग्लाइकोसिलेशन की निष्पक्ष खोज और लक्षण वर्णन को सक्षम करने के लिए यूकेरियोटिक-केंद्रित विधियों की सीमाओं को दूर करता है, जिसमें रोगजनकों और आर्किया में नवीन ग्लाइकेन्स भी शामिल हैं।

Pabst, M., Soic, D.2026-04-16

📄 systems biology

Deep quantitative phosphoproteomics identifies non-canonical pH-sensitive yeast phosphorylation networks

यह अध्ययन यीस्ट में एक विशिष्ट, गैर-कैनोनिकल (non-canonical) अम्ल-अनुक्रियाशील फॉस्फोरिलीकरण नेटवर्क को प्रकट करने के लिए गहन मात्रात्मक फॉस्फोप्रोटिओमिक्स का उपयोग करता है जो पारंपरिक TORC2 और PKC मार्गों से स्वतंत्र रूप से कार्य करता है, जिसमें झिल्ली-बद्ध (membrane-tethered) काइनेज Yck1 को अम्ल तनाव संकेतन के एक प्रमुख मध्यस्थ के रूप में पहचाना गया है।

Su, X., Gajri, A., Torres, M. P.2026-04-15

📄 systems biology

Targeting HIV at its core: A mathematical model for optimizing Tat Inhibitor-based therapies toward enhanced functional cure strategies

यह अध्ययन संयोजन एंटीरेट्रोवाइरल थेरेपी और टैट (Tat) अवरोधकों के तहत एचआईवी संक्रमण की गतिशीलता का विश्लेषण करने के लिए एक नियतात्मक गणितीय मॉडल विकसित करता है, जो वायरल क्लीयरेंस के लिए स्थितियाँ स्थापित करता है और सुप्त भंडारों (latent reservoirs) को लक्षित करके कार्यात्मक उपचार को अनुकूलित करने की रणनीतियों का मूल्यांकन करता है।

Waema, R., Adongo, C., Lago, S., Ogutu, K.2026-04-15

📄 systems biology

Heterogeneous, Population-Level Drug-Tolerant Persisters Exhibit Ion-Channel Remodeling and Ferroptosis Susceptibility

यह अध्ययन ड्रग-टोलरेंट पर्सिस्टर्स (DTPs) को एक समान एकल-कोशिका अवस्था के रूप में नहीं, बल्कि विशिष्ट उप-अवस्थाओं और परिवर्तित आयन-चैनल गतिविधि वाले विषम, जनसंख्या-स्तरीय "आइडलिंग" संग्रहों के रूप में पुनर्व्याख्या करता है जो सामूहिक रूप से लगभग शून्य शुद्ध वृद्धि प्रदर्शित करते हुए भी फेरोप्टोसिस के प्रति संवेदनशील रहते हैं, जिससे ट्यूमर ड्रग टॉलरेंस को समाप्त करने के लिए सेल-टाइप-केंद्रित रणनीतियों से "टारगेटेड लैंडस्केपिंग" दृष्टिकोणों की ओर बदलाव का समर्थन किया जाता है जो फेनोटाइपिक विषमता को नियंत्रित करते हैं।

Hayford, C. E., Baleami, B., Stauffer, P. E., Paudel, B. B., Al'Khafaji, A., Brock, A., Quaranta, V., Tyson, D. R., Harr (…)2026-04-13

📄 systems biology

Pushing the limits of SCP: bacSCP, a proof-of-concept study to investigate heterogeneity of bacteria by single cell proteomics.

यह अध्ययन bacSCP को प्रस्तुत करता है, जो एक नवीन सिंगल-सेल प्रोटिओमिक्स प्रोटोकॉल है जो व्यक्तिगत *Bacillus subtilis* और *Escherichia coli* कोशिकाओं में प्रोटीन विषमता को मापने के लिए बैक्टीरिया-विशिष्ट विश्लेषणात्मक चुनौतियों पर विजय प्राप्त करता है, जो बैक्टीरिया की आबादी के भीतर हीट-स्ट्रेस प्रतिक्रियाओं में महत्वपूर्ण परिवर्तनशीलता को प्रकट करता है।

Leodolter, J., Thierer, T., Mechtler, K., Matzinger, M.2026-04-13

📄 systems biology

Modeling and dissecting bidirectional feedback in gene-metabolite systems using the CausalFlux method

यह शोध पत्र CausalFlux प्रस्तुत करता है, जो एक नवीन विधि है जो द्विदिशीय जीन-मेटाबोलाइट फीडबैक को कैप्चर करने के लिए जीनोम-स्केल मेटाबॉलिक मॉडल के साथ बेयसियन जीन रेगुलेटरी नेटवर्क को एकीकृत करती है, जो मौजूदा एक-तरफा फीडबैक मॉडल की तुलना में रिएक्शन फ्लक्स और जीन अनिवार्यता की भविष्यवाणी करने में काफी बेहतर सटीकता प्रदर्शित करती है।

Subramanian, N., Kumar, S. P., Rengaswamy, R., Bhatt, N. P., Narayanan, M.2026-04-13

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